Metrikler
Yayın
93
Açık Erişim
11
BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları
Eğitim Bilgileri
2010 - 2016
2010 - 2016Doktora
Gazi Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Türkiye
2006 - 2009
2006 - 2009Yüksek Lisans
Hacettepe Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Türkiye
2001 - 2006
2001 - 2006Lisans
Hacettepe Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji, Türkiye
Yaptığı Tezler
2016
2016Doktora
Nonalkolik karaciğer yağlanması olan hastalar ve sağlıklı bireylerde bağırsak mikrobiyotasının moleküler yöntemlerle incelenmesi
Gazi Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü
Yabancı Diller
C1 İleri
C1 İleriİngilizce
Araştırma Alanları
Tıp
Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji
Tıbbi Mikrobiyoloji
Sağlık Bilimleri
Temel Tıp Bilimleri
Akademik Ünvanlar / Görevler
2011 - Devam Ediyor
2011 - Devam EdiyorDoç. Dr.
Hacettepe Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi, Temel Eczacılık Bilimleri Bölümü
Akademi Dışı Deneyim
2015 - 2016
2015 - 2016Misafir Araştırmacı
New York Üniversitesi, Misafir Araştırmacı
Makaleler
Tümü (34)
SCI-E, SSCI, AHCI (31)
SCI-E, SSCI, AHCI, ESCI (32)
ESCI (1)
Scopus (32)
TRDizin (6)
Diğer Yayınlar (1)
2026
20261. Synthesis, crystallography, biological activity, and molecular modeling studies of some 3-Aryl-2-(4-(substitutedphenyl)thiazol-2-yl) acrylonitrile derivatives
Anas S., Moncol J., NİGİZ Ş., ÖZKUL KOÇAK C., Vagolu S. K., SARI S., et al.
JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE
, cilt.1350, 2026 (SCI-Expanded, Scopus)
2025
20252. Exploring bisbenzimidazole-chalcone hybrid compounds: Dual-action as antibacterial agents targeting biofilm formation and E. coli DNA gyrase inhibition
Adal E., Oksuz Z., ÖZKUL KOÇAK C., NİGİZ Ş., Alagoz M. A., DÖĞEN A., et al.
JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE
, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2025
20253. Metabolic and genotypic characterization of meropenem-susceptible and meropenem-resistant Serratia marcescens isolates.
Nigiz Ş., Hazırolan G., Gelmez G. A., Koçak C., Koçak E., Kablan S. E., et al.
Turkish journal of medical sciences
, cilt.55, sa.4, ss.1024-1034, 2025 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)
2025
20254. Co-delivery of azithromycin and nisin through liposomes for skin infection to reduce antimicrobial drug resistance
Gelen-Gungor D., NİGİZ Ş., ÖZKUL KOÇAK C., Eroglu H., NEMUTLU E., ULUBAYRAM K., et al.
INTERNATIONAL JOURNAL OF PHARMACEUTICS
, cilt.679, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
20245. Molecular characterization and antibiotic resistance of clinical Bacteroides and related genera from a tertiary care center in Turkiye
DEMİR M., Soki J., Tanriverdi E. S., ÖZKUL KOÇAK C., Mahmood B., OTLU B., et al.
ANAEROBE
, cilt.90, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
20246. Alteration in gut microbial characteristics of patients with acromegaly.
Babayeva A., Ozkul C., Coskun M., Uzun A., Yalcin M. M., Yalinay M., et al.
Endocrine
, cilt.85, ss.855-863, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
20247. In Vivo Comparison of the Efficacy and Duration of Local Antibiotics on Smooth, Textured and Polyurethane Implant Surfaces.
Karakas E., Ayhan M. S., Karasu O., Kocak C., Yalinay M.
Aesthetic plastic surgery
, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
20248. Inulin protects against the harmful effects of dietary emulsifiers on mice gut microbiome.
Bekar C., Ozmen O., Ozkul C., Ayaz A.
PeerJ
, cilt.12, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
20249. Determination of oral and gut mucosal microbiome profiles of patients with treatment-naïve ulcerative colitis
Karakan T., Kurtulus N. O., ÜNSAL F. B., İŞLER S. Ç., Akca G., Soysal F., et al.
JOURNAL OF CROHNS & COLITIS
, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2023
202310. Electrochemical biosensors for rapid diagnosis of bacterial infections: Design, targets and applications in clinical setting
Koçak E., ÖZKUL KOÇAK C., BOZAL PALABIYIK B., SÜSLÜ İ., USLU B.
Electroanalysis
, cilt.35, sa.11, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2023
202311. Crohn’s Disease Prediction Using Sequence Based Machine Learning Analysis of Human Microbiome
ÜNAL M., BOSTANCI G. E., ÖZKUL KOÇAK C., AÇICI K., Asuroglu T., GÜZEL M. S.
Diagnostics
, cilt.13, sa.17, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2023
202312. Evaluation of In Vitro Activity of Ceftolozane/Tazobactam and Ceftazidime/Avibactam Against Carbapenem-Resistant Pseudomonas aeruginosa Strains and Mechanisms of Carbapenem Resistance: Data from Tertiary Care Hospital
HAZIROLAN G., ÖZKUL KOÇAK C.
Jundishapur Journal of Microbiology
, cilt.16, sa.3, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2022
202213. Exometabolomic analysis of susceptible and multi-drug resistant Pseudomonas aeruginosa
Koçak E., Nigiz Ş., Özkan E., Erdoğan Kablan S., Hazirolan G., Nemutlu E., et al.
LETTERS IN APPLIED MICROBIOLOGY
, cilt.75, sa.2, ss.234-242, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)
2022
202214. First Report of Plasmid-Mediated fosA6 Harboring Klebsiella Pneumoniae Isolate in Turkey
HAZIROLAN G., ÖZKUL KOÇAK C.
Clinical Laboratory
, cilt.68, sa.11 November, ss.2428-2429, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)
2021
202115. Integrative proteomics and metabolomics approach to elucidate the antimicrobial effect of simvastatin on Escherichia coli
Kocak E., NEMUTLU E., KIR S., SAĞIROĞLU M., ÖZKUL KOÇAK C.
BIOMEDICAL CHROMATOGRAPHY
, cilt.35, sa.10, 2021 (SCI-Expanded, Scopus)
2021
202116. Gut Microbiome Alteration after Reboxetine Administration in Type-1 Diabetic Rats
Aydin S., ÖZKUL KOÇAK C., Yucel N. T., KARACA GENÇER H.
MICROORGANISMS
, cilt.9, sa.9, 2021 (SCI-Expanded, Scopus)
2021
202117. Oxacillinase Gene Distribution, Antibiotic Resistance, and Their Correlation with Biofilm Formation inAcinetobacter baumanniiBloodstream Isolates
ÖZKUL KOÇAK C., HAZIROLAN G.
MICROBIAL DRUG RESISTANCE
, cilt.27, ss.637-646, 2021 (SCI-Expanded, Scopus)
2021
202118. Characterization of gut microbiota in polycystic ovary syndrome: Findings from a lean population
Mammadova G., ÖZKUL KOÇAK C., YILMAZ IŞIKHAN S., AÇIKGÖZ A., YILDIZ O. B.
EUROPEAN JOURNAL OF CLINICAL INVESTIGATION
, cilt.51, sa.4, 2021 (SCI-Expanded, Scopus)
2021
202119. Comparative Proteomic Analysis of Escherichia coli Under Ofloxacin Stress
KOÇAK E., ÖZKUL KOÇAK C.
TURKISH JOURNAL OF PHARMACEUTICAL SCIENCES
, cilt.18, sa.2, ss.133-139, 2021 (ESCI, Scopus, TRDizin)
2021
202120. Gut-brain-microbiota axis: Antibiotics and functional gastrointestinal disorders
KARAKAN T., ÖZKUL KOÇAK C., Akkol E. K., BİLİCİ S., Sobarzo-Sánchez E., Capasso R.
Nutrients
, cilt.13, sa.2, ss.1-18, 2021 (SCI-Expanded, Scopus)
2020
202021. Effects of endothelin receptor blockade and COX inhibition on intestinal I/R injury in a rat model: Experimental research
Ucar B. I., Erikci A., Kosemehmetoglu K., Ozkul C., Iskit A. B., Ucar G., et al.
INTERNATIONAL JOURNAL OF SURGERY
, cilt.83, ss.89-97, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)
2020
202022. A single early-in-life antibiotic course increases susceptibility to DSS-induced colitis
ÖZKUL KOÇAK C., Ruiz V. E., Battaglia T., Xu J., Roubaud-Baudron C., Cadwell K., et al.
GENOME MEDICINE
, cilt.12, sa.1, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)
2020
202023. Development of besifloxacin HCl loaded nanofibrous ocular inserts for the treatment of bacterial keratitis: In vitro, ex vivo and in vivo evaluation
POLAT H. K., Pehlivan S. B., Ozkul C., ÇALAMAK S., Ozturk N., AYTEKİN E., et al.
INTERNATIONAL JOURNAL OF PHARMACEUTICS
, cilt.585, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)
2020
202024. Structural changes in gut microbiome after Ramadan fasting: a pilot study
Ozkul C., Yalinay M., Karakan T.
BENEFICIAL MICROBES
, cilt.11, sa.3, ss.227-233, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)
2019
201925. Long-Term Effects of Early-Life Antibiotic Exposure on Resistance to Subsequent Bacterial Infection.
Roubaud-Baudron C., Ruiz V., Swan A., Vallance B., Ozkul C., Pei Z., et al.
mBio
, cilt.10, 2019 (SCI-Expanded, Scopus)
2019
201926. Islamic fasting leads to an increased abundance of Akkermansia muciniphila and Bacteroides fragilis group: A preliminary study on intermittent fasting
Ozkul C., Yalinay M., Karakan T.
TURKISH JOURNAL OF GASTROENTEROLOGY
, cilt.30, sa.12, ss.1030-1035, 2019 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)
2019
201927. Design, synthesis and computational analysis of novel acridine-(sulfadiazine/sulfathiazole) hybrids as antibacterial agents
GÜNDÜZ M. G., Tahir M. N., Armakovic S., Kocak C., Armakovic S. J.
JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE
, cilt.1186, ss.39-49, 2019 (SCI-Expanded, Scopus)
2019
201928. Karbapeneme Dirençli Klebsiella pneumoniae Klinik İzolatlarındaKolistin Direnci
ÖZKUL KOÇAK C., HAZIROLAN G.
Türk Mikrobiyoloji Cem Derg
, cilt.49, sa.1, ss.17-23, 2019 (TRDizin)
2018
201829. Mikrobiyota Tanımlama Yöntemleri
ÖZKUL KOÇAK C., YALINAY A. M.
Turkiye Klinikleri Gastroenterohepatology , cilt.11, ss.5-11, 2018 (Hakemli Dergi)
2017
201730. Determination of certain bacterial groups in gut microbiota and endotoxin levels in patients with nonalcoholic steatohepatitis
Ozkul C., Yalinay M., Karakan T., Yilmaz G.
TURKISH JOURNAL OF GASTROENTEROLOGY
, cilt.28, sa.5, ss.361-369, 2017 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)
2015
201531. Ag/silk fibroin nanofibers: Effect of fibroin morphology on Ag+ release and antibacterial activity
ÇALAMAK S., AKSOY E. A., Ertas N., ERDOĞDU C., SAĞIROĞLU M., ULUBAYRAM K.
EUROPEAN POLYMER JOURNAL
, cilt.67, ss.99-112, 2015 (SCI-Expanded, Scopus)
2015
201532. Silver nanoparticle containing silk fibroin bionanotextiles
ÇALAMAK S., AKSOY E. A., ERDOĞDU C., SAĞIROĞLU M., ULUBAYRAM K.
JOURNAL OF NANOPARTICLE RESEARCH
, cilt.17, sa.2, 2015 (SCI-Expanded, Scopus)
2014
201433. Silk fibroin based antibacterial bionanotextiles as wound dressing materials
ÇALAMAK S., Erdogdu C., Ozalp M., ULUBAYRAM K.
MATERIALS SCIENCE & ENGINEERING C-MATERIALS FOR BIOLOGICAL APPLICATIONS
, cilt.43, ss.11-20, 2014 (SCI-Expanded, Scopus)
2014
201434. Detection of cagA and vacA genotypes of Helicobacter pylori isolates from a university hospital in Ankara region, Turkey
Erdogdu C., SARIBAŞ Z., Yilmaz Y. A.
TURKISH JOURNAL OF MEDICAL SCIENCES
, cilt.44, sa.1, ss.126-132, 2014 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)
Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler
2022
20221. Taguchi ve Faktöriyel Deney Tasarım Metotlarının Karşılaştırması: Lactobacillus spp. ERIC-PCR Optimizasyonu Örneği
YILMAZ IŞIKHAN S., ÖZKUL KOÇAK C.
23. Ulusal ve 6. Uluslararası Biyoistatistik Kongresi, Ankara, Türkiye, 26 Ekim 2022, (Tam Metin Bildiri)
2021
20212. Mikrobiyom Verilerinde Kullanılan İstatistiksel Analizler: Obezite İlişkili Mikrobiyom Sekans Verisi Üzerinde bir Uygulama
YILMAZ IŞIKHAN S., ÖZKUL KOÇAK C.
22. Ulusal ve 5. Uluslararası Biyoistatistik Kongresi, Ankara, Türkiye, 28 - 30 Ekim 2021, (Tam Metin Bildiri)
2020
20203. Seçici noradrenalin gerialım inhibitörü reboksetinin intestinal mikrobiyom üzerine etkisi
ÖZKUL KOÇAK C., KARACA GENÇER H., AYDIN TEKİNKOCA S.
TMC 2020 Çevrim İçi Mikrobiyoloji Sempozyumu, Türkiye, 27 Aralık 2020, (Özet Bildiri)
2020
20204. Investigation of clonal relationship, carbapenemases and colistin resistance in multi drug resistant Acinetobacter baumannii clinical isolates
ÖZKUL KOÇAK C.
International Euroasian Conference on Biotechnology and Biochemistry, Ankara, Türkiye, 16 Şubat 2020, (Özet Bildiri)
2019
20195. Structural changes in gut microbiome of diabetic mice after Reboxetin treatment
TEKİNKOCA S., ÖZKUL KOÇAK C., KARACA GENÇER H.
HELICOBACTER, Innsbruck, Avusturya, 5 - 07 Eylül 2019, cilt.24, (Özet Bildiri)
2019
20196. Compositional analysis of ocular surface microbiome in blepharitis
ÖZKUL KOÇAK C., YALINAY A. M., AKATA R. F.
HELICOBACTER, Innsbruck, Avusturya, 5 - 07 Eylül 2019, cilt.24, (Özet Bildiri)
2019
20197. THE INTEGRATED PROTEOMICS AND METABOLOMICS ANALYSIS OFESCHERICHIA COLI UNDER OFLOXACIN STRESS
KOÇAK E., ÖZKUL KOÇAK C.
International Multidisciplinary Symposium on Drug Research and Development, 1 - 03 Temmuz 2019, (Tam Metin Bildiri)
2019
20198. GUT MICROBIOME AND OBESITY ASSOCIATEDDISEASES: CURRENT PERSPECTIVE
ÖZKUL KOÇAK C.
International Multidisciplinary Symposium on Drug Research and Development, 1 - 03 Temmuz 2019, (Tam Metin Bildiri)
2019
20199. Evaluation of Antimicrobial Effect of Simvastatin on E. coli with Metabolomics Analysis
KOÇAK E., ÖZKUL KOÇAK C., KAPLAN O., ÇELEBİER M., NEMUTLU E., KIR S., et al.
1st International Congress on Analytical and Bioanalytical Chemistry, Antalya, Türkiye, 27 Mart 2019, (Tam Metin Bildiri)
2018
201810. Kafeterya Diyeti İle Beslenen Anne Ratların Anne Sütü Alan Yavrularında MikrobiyotaDüzeylerinin İncelenmesi
ADİLOĞLU A. K., Teker T., ÖZKUL KOÇAK C., YALINAY A. M., Öztürk B., EYERCİ N.
Türk Mikrobiyoloji Kongresi XXXVIII International Uluslararası Turkish Microbiology Congress, 4 - 08 Kasım 2018, (Özet Bildiri)
2018
201811. Oruç tutan bireylerde oruç öncesi ve sonrası bağırsak mikrobiyotası farklılıklarının metagenomik olarak incelenmesi
ÖZKUL KOÇAK C., YALINAY A. M., KARAKAN T.
5. Ulusal Bağırsak Mikrobiyotası ve probiyotik Kongresi, Türkiye, 11 - 14 Ekim 2018, (Tam Metin Bildiri)
2018
201812. Determination of acid dissocition constant and antimicrobial activity of condensed 1,4 dihydropyridine derivatives
ÖZKUL KOÇAK C., KOÇAK E.
12 th International symposium on pharmaceutical sciences, 26 Haziran 2018, (Özet Bildiri)
2018
201813. Mikropipette Mikrobiyota:Analiz Yöntemleri
ÖZKUL KOÇAK C.
İnönü Üniversitesi bilimsel Araştırma topluluğu 5.Ulusal Tıp Öğrenci Kongresi, Türkiye, 27 Nisan 2018, (Tam Metin Bildiri)
2017
201714. Bağırsak Mikrobiyotası ve Metagenomik Yaklaşım
ÖZKUL KOÇAK C.
4. Ulusal Klinik Mikrobiyoloji Kongresi, Antalya, Türkiye, 8 - 12 Kasım 2017, (Tam Metin Bildiri)
2017
201715. Effect of microbial restoration after early-life antibiotic treatment on intestinal microbial communities and on host gene expression and function
Ruiz V., Battaglia T., ERDOĞDU C., Blaser M. J.
50th Annual MACUB Conference, 28 Ekim 2017, (Tam Metin Bildiri)
2017
201716. Obezitede Bağırsak Mikrobiyota Metagenom Analizleri
ÖZKUL KOÇAK C., YALINAY A. M., KARAKAN T., Battaglia T., Blaser M. J.
4. Ulusal Bağırsak Mikrobiyotası ve Probiyotik Kongresi, Antalya, Türkiye, 19 Ekim 2017, (Özet Bildiri)
2017
201717. Açlık Süreçlerinin Etkisini Göstermek Amacıyla Oruç Tutan Bireylerde Bağırsak Mikrobiyota Analizleri
ERDOĞDU C., KARAKAN T., YALINAY A. M.
4. Ulusal Bağırsak Mikrobiyotası ve Probiyotik Kongresi, Türkiye, 19 - 22 Ekim 2017, (Özet Bildiri)
2017
201718. Determination of Antimicrobial Activity of Some Probiotic Preparations and A. muciniphila against enteric pathogens
SAĞIROĞLU M., ÖZKUL KOÇAK C.
International Multidisciplinry Symposium on Drug Research and Development, 5 - 07 Ekim 2017, (Özet Bildiri)
2017
201719. Bacteriome and mycobiome analysis underscore the role of fungal dybiosis in nonalcoholic steatohepatitis: Fusarium genus as a novel player?
KARAKAN T., YALINAY A. M., ERDOĞDU C.
XXXth International Workshop on Helicobacter Microbiota in Inflammation Cancer, Bordeaux, Fransa, 6 - 09 Eylül 2017, cilt.22, (Özet Bildiri)
2017
201720. Effect of single early-in-life antibiotic course on microbial community structure and susceptbility to DSS-induced colitis
ERDOĞDU C., Ruiz V., Battaglia T., Blaser M. J., Cadwell K.
XXXth International Workshop on Helicobacter Microbiota in Inflammation Cancer, 7 - 09 Eylül 2017, (Özet Bildiri)
2017
201721. Effect of single early-in-life antibiotic course on microbial community structure and susceptibility to DSS-induced colitis
Ozkul C., Ruiz V., Battaglia T., Cadwell K., Blaser M.
30th International Workshop of the European-Helicobacter-and-Microbiota-Study-Group (EHMSG) on Helicobacter and Microbiota in Inflammation and Cancer, Bordeaux, Fransa, 7 - 09 Eylül 2017, cilt.22, (Özet Bildiri)
2017
201722. Restoring mirobial communities and host phenotypes after early-life pulsed antibiotic treatment
Ruiz V., Battaglia T., Mericien V., ERDOĞDU C., Blaser M. J.
Keystone-Microbiome in Health and Disease, 5 - 09 Şubat 2017, (Özet Bildiri)
2017
201723. Restoring mirobial communities and host phenotypes after early-life pulsed antibiotic treatment
Ruiz V., Battaglia T., Mericien V., ERDOĞDU C., Blaser M. J.
Keystone-Microbiome in Health and Disease, 5 - 09 Şubat 2017, (Özet Bildiri)
2016
201624. İnflamatuvar Bağırsak Hastalıkları ve Erken Dönem Antibiyotik Kullanımı
ERDOĞDU C.
1. Ulusal Mikrobiyota Kongresi ve Sağlığımıza Etkileri, Türkiye, 8 - 10 Aralık 2016, (Tam Metin Bildiri)
2016
201625. NONALKOLİK KARACİĞER YAĞLANMASI OLAN HASTALARDA BARSAK MİKROBİYOTASININ YENİ NESİL DİZİ ANALİZİ İLE KARŞILAŞTIRILMASI
ERDOĞDU C., YALINAY A. M., KARAKAN T., Blaser M. J., Battaglia T.
Türk Mikrobiyoloji Kongresi, Türkiye, 16 - 21 Kasım 2016, (Tam Metin Bildiri)
2016
201626. Polycationic Polymeric Brush Decoration on Polyurethane for Dual Effective Antibacterial Activity
GÜLTEKİNOĞLU M., sarısözen y. t., ERDOĞDU C., SAĞIROĞLU M., Oh Y. J., Hinterdorfer P., et al.
46th IUPAC WORLD POLYMER CONGRESS, 17 - 21 Temmuz 2016, (Tam Metin Bildiri)
2016
201627. Polycationic Polymeric Brush Decoration on Polyurethane Dual Effective Antibacterial Activity
GÜLTEKİNOĞLU M., TUNÇ SARISÖZEN Y., ERDOĞDU C., SAĞIROĞLU M., JIN OH Y., HINTERDORFER P., et al.
46th IUPAC World Polymer Congress MACRO2016, Türkiye, 17 - 21 Temmuz 2016, (Özet Bildiri)
2016
201628. Dominant Bifidobacterium and Lactobacillus Species in Patients with Non alcoholic Fatty Liver Disease
ERDOĞDU C., YALINAY A. M., KARAKAN T.
ASM Microbe, 16 - 20 Haziran 2016, (Tam Metin Bildiri)
2016
201629. Increased Akkermansia muciniphila and Bacteroides fragilis Group Abundance After Islamic Fasting
ERDOĞDU C., YALINAY A. M., KARAKAN T.
ASM Microbe, 16 - 20 Haziran 2016, (Tam Metin Bildiri)
2016
201630. Gut Microbiota in Patients with Non Alcoholic Fatty Liver Disease
ERDOĞDU C., YALINAY A. M., KARAKAN T.
ASM Microbe, 16 - 20 Haziran 2016, (Tam Metin Bildiri)
2016
201631. Effect of early life antibiotic treatment on severity of DSS induced colitis
ERDOĞDU C., RUIZ V., BLASER M. J.
Department of Medicine 14th Annual Research Day, 26 Mayıs 2016, (Tam Metin Bildiri)
2015
201532. Non Alkolik Karaciğer Yağlanması Olan Hastalarda Barsak Mikrobiyotası
ERDOĞDU C., ÇIRAK A. M., KARAKAN T.
3. Ulusal Klinik Mikrobiyoloji Kongresi, Antalya, Türkiye, 18 - 22 Kasım 2015, (Özet Bildiri)
2014
201433. Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835 suşunda genom boyu in silico analiz ile bakteriyosin varlığının araştırılması ve in-vitro antimikrobiyal aktivitesinin belirlenmesi
ÖZKUL KOÇAK C., Dündar H., YALINAY A. M.
XXXVI. Türk Mikrobiyoloji Kongresi, Antalya, Türkiye, 12 Kasım 2014, (Özet Bildiri)
2014
201434. Antioxidant antimicrobial activities and total phenolic content of Prunus spinosa L subsp dasyphylla Schur Domin and its secondary metabolites
ÇANKAYA İ. İ., Anul S., EKİZOĞLU M., ERDOĞDU C., ÇİÇEK POLAT D., COŞKUN M.
2nd International Conference and Exhibition on Pharmacognosy, Phytochemistry & Natural Products, 25 - 27 Ağustos 2014
2014
201435. Biological activities and phytochemical analysis of Prunus spinosa L subsp dasyphylla Schur Domin
ÇANKAYA İ. İ., Anul S., EKİZOĞLU M., ERDOĞDU C.
9th International Symposium on Chromatography of Natural Products, 26 - 29 Mayıs 2014
2012
201236. Prunus spinosa L subsp Dasyphylla Schur domin türünün radikal süpürücü ve antimikrobiyal aktiviteleri ve total fenol içeriği
Serap A., ÇANKAYA İ. İ., EKİZOĞLU M., ERDOĞDU C., Polat Ç., COŞKUN M.
20. Bitkisel İlaç Hammaddeleri Toplantısı, Türkiye, 10 - 13 Ekim 2012
2011
201137. Helicobacter pylori cagA geni ve vacA alellik tiplerinin genomik incelenmesi
ÖZKUL KOÇAK C., YALINAY A. M., AKYÖN YILMAZ Y.
1. Ulusal Klinik Mikrobiyoloji Kongresi, Antalya, Türkiye, 13 Kasım 2011, (Özet Bildiri)
2011
201138. An investigation of disinfectant resistance gene in hospital isolated gram negative bacteria Microbes in Applied Research Current Advances and Challenges 461 463 Supp olarak basılı
KART D., EKİZOĞLU M., Özkul C., GÜLMEZ KIVANÇ D., SAĞIROĞLU M.
IV International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology, Malaga, İspanya, 14 - 16 Ekim 2011, ss.461-463, (Özet Bildiri)
2009
200939. Detection of H. pylori vacA and cagA Virulence Genotypes by PCR
ÖZKUL KOÇAK C., Saribas Z., Yilmaz Y.
22nd International Workshop on Helicobacter and Related Bacteria in Chronic Digestive Inflammation and Gastric Cancer, Oporto, Portekiz, 17 - 19 Eylül 2009, cilt.14, ss.376, (Özet Bildiri)
2009
200940. Sterilizasyon Öncesi Dezenfeksiyon Gerekliliği
Usta A., Ünal S., ATAÇ A. S., ÖZKUL KOÇAK C., MİRZA H. C.
6. Ulusal Sterilizasyon Dezenfeksiyon Kongresi, Antalya, Türkiye, 1 - 05 Nisan 2009, (Özet Bildiri)
2008
200841. Genotyping of cagA and vacA of H. pylori isolates from patients with gastrointestinal diseases
SARIBAŞ Z., ÖZKUL KOÇAK C., AKYÖN YILMAZ Y.
XXIst International Workshop on Helicobacter and related bacteria in chronic digestive inflammation, Riga, Letonya, 18 Eylül 2008, (Özet Bildiri)
Kitaplar
2018
20181. Mikrobiyota Tanımlama Yöntemleri
ÖZKUL KOÇAK C., YALINAY A. M.
Türkiye Klinikleri Gastroenteropatoloji Özel Konular - Bağırsak Mikrobiyotası, Prof. Dr. Hakan Alagözlü, Editör, Türkiye Klinikleri (Ortadoğu Reklam Tanıtım Yayıncılık Turizm Eğitim İnşaat Sanayi ve Ticaret A.Ş.), Ankara, ss.5-11, 2018
2018
20182. Mikrobiyolojik Yöntemler
ERYILMAZ M., DEMİRTAŞ A., ERAÇ B., TAŞLI H., EKİZOĞLU M., KART D., et al.
Türk Farmakopesi 2017, , Editör, T.C. Sağlık Bakanlığı Türkiye İlaç ve Tıbbi Cihaz Kurumu, 2018
2017
20173. Nonfermenterlerin İzolasyonu İçin Öneriler En Sık Rastlanan Türlerin Tanımlanması
ÖZKUL KOÇAK C.
Koneman’s Color Atlas andTextbook of Diagnostic Microbiology, Ahmet Başustaoğlu, Ayşe Dürdal Us, Editör, Hipokrat Yayınevi, ss.389, 2017
Desteklenen Projeler
2025 - Devam Ediyor
2025 - Devam EdiyorPseudomonas aeruginosa izolatlarının adaptif laboratuvar evrimi ALE yöntemiyle kolistin maruziyeti sonrası fenotipik transkriptomik metabolomik profillerinin karşılaştırmalı analizi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ÖZKUL KOÇAK C. (Yürütücü), DUMAN E., HAZIROLAN G., SAĞIROĞLU M., NEMUTLU E., NİGİZ Ş.
2025 - 2028
2025 - 20282'-Fukozillaktoza Adapte Olmuş Yeni Bifidobacterium Suşlarının Erken Antibiyotik Ilişkili Disbiyozis Üzerindeki Etkisinin Değerlendirilmesi
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
Özkul Koçak C. (Yürütücü), Dinleyici E. Ç., Ekim B., Ceylan A., Özgenç Çınar Ö., Koçak E.
2023 - 2026
2023 - 2026Fonksiyonel Gıda Uygulamaları İçin Sentetik Biyoloji Yaklaşımı Ile Anne Sütü Oligosakkariti Üreten Probiyotik Bakteri Suşunun Tasarlanması
TÜBİTAK Projesi , 1003 - Öncelikli Alanlar Ar-Ge Projeleri Destekleme Programı
Özkul Koçak C. (Yürütücü)
2022 - 2026
2022 - 2026Glioblastom Tedavisinde Kullanılmak Üzere Karfilzomib İçeren Bakteri Destekli- Plga Nanopartikül Formülasyonlarının Tasarlanması Ve İn Vitro/İn Vivo Değerlendirilmesi
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
Akdağ Çaylı Y., Mut Aşkun M., Şeker U. Ö. Ş., Öner L., Özkul Koçak C., Karataş M., et al.
2022 - 2024
2022 - 2024Fagositer Sistem Hastalıklarında Fonksiyonel Mikrobiyotanın Karakterizasyonu ve Metabolomik Çalışmalar (220S123 no'lu TUBITAK 1001 projesine ek bütçe desteği)
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ÇAĞDAŞ AYVAZ D. N. (Yürütücü), TEZCAN F. İ., ESENBOĞA S., ÖZKUL KOÇAK C., NEMUTLU E.
2022 - 2024
2022 - 2024Klebsiella pneumoniae kan izolatlarında karbapenem direncinin ve virülansın fenotipik genomik ve metabolomik yaklaşımlarla araştırılması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
HAZIROLAN G. (Yürütücü), NEMUTLU E., NİGİZ Ş., ÖZKUL KOÇAK C.
2022 - 2024
2022 - 2024Metisiline dirençli Staphylococcus aureus MRSA kaynaklı deri enfeksiyonların tedavisi için topikal uygulanacak ilaç taşıyıcı sistemlerin geliştirilmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ŞENEL S. (Yürütücü), ÖZKUL KOÇAK C., KÖSEMEHMETOĞLU K., KILIÇ A. O., TÜRKMEN E.
2021 - 2023
2021 - 2023Klinik Bacteroides fragilis grubu izolatlarında endotoksin ve antibiyotik direnç genlerinin prevalansı moleküler tiplendirilmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
HAZIROLAN G. (Yürütücü), DEMİR ÇUHA M., ÖZKUL KOÇAK C., OTLU B.
2021 - 2022
2021 - 2022Gıda Emülgatörleri ve İnülinin Farelerde İntestinal Mikrobiyota Üzerine Etkisinin Değerlendirilmesi
TÜBİTAK Projesi , 1002 - Hızlı Destek Programı
(Proje Özeti)
BEKAR C. (Yürütücü), ÖZMEN Ö., ÖZKUL KOÇAK C.
2021 - 2022
2021 - 2022Metabolik Sendrom Rat Modelinde Farklı Mikrobiyota Manipülasyon Stratejilerinin Etkinliğinin Değerlendirilmesi
Diğer Özel Kurumlarca Desteklenen Proje
Özkul Koçak C.
2017 - 2020
2017 - 2020Çeşitli Hastalıkların Patogenezinde Bağırsak Mikrobiyotasının Rolu
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Alt Yapı
AKYÖN YILMAZ Y. (Yürütücü), BOZDAĞ G., ERDOĞDU C., YILDIZ O. B., DURSUN E., ERGÜNAY K., et al.
2018 - 2019
2018 - 2019Polikistik Over Sendromlu Obez Kadınlarda İntestinal Mikrobiyotanın Reproduktif Sistem ve Metabolizma Üzerine Etkilerinin İncelenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
YILDIZ O. B. (Yürütücü), AÇIKGÖZ A., EYÜPOĞLU N. D., YILMAZ IŞIKHAN S., ÖZKUL C., ÇALIŞKAN E.
2016 - 2017
2016 - 2017Nonalkolik Karaciğer Yağlanması Olan Hastalarda Mikrobiyota Analizleri
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ÖZKUL KOÇAK C. (Yürütücü), ERDOĞAN KABLAN S.
2016 - 2017
2016 - 2017Polikistik over sendromlu ve sağlıklı kadınlarda bağırsak mikrobiyota üyelerinden Prevotella melaninogenica ve Ruminococcus torques karşılaştırılması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
YILDIZ O. B. (Yürütücü), AKYÖN YILMAZ Y., ZENGİN M., MAMMADOVA G., ERDOĞDU C.
2014 - 2015
2014 - 2015Nonalkolik Karaciğer Yağlanması Olan Hastalar ve Sağlıklı Bireylerde Barsak Mikrobiyotasının Moleküler Yöntemlerle Karşılaştırılması
TÜBİTAK Projesi
ÖZKUL KOÇAK C.