Metrikler
Yayın
56
Açık Erişim
8
BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları
Eğitim Bilgileri
2019 - 2025
2019 - 2025Doktora
Hacettepe Üniversitesi, Tıp Fakültesi (Türkçe), Temel Tıp Bilimleri Bölümü, Türkiye
2016 - 2019
2016 - 2019Yüksek Lisans
Hacettepe Üniversitesi, Tıp Fakültesi (Türkçe), Temel Tıp Bilimleri Bölümü, Türkiye
2012 - 2016
2012 - 2016Lisans
Hacettepe Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, İstatistik A.B.D., Türkiye
Yaptığı Tezler
2025
2025Doktora
Klinik Karar Vermede Radyogenomiks Tabanlı Bir Yaklaşım
Hacettepe Üniversitesi, Tıp Fakültesi (Türkçe), Temel Tıp Bilimleri Bölümü
2019
2019Yüksek Lisans
Transkriptom Veri Seti Üzerinde Derin Öğrenme Yöntemi İle Klasik Veri Madenciliği Yöntemlerinin Sınıflama Performanslarının Karşılaştırılması
Hacettepe Üniversitesi, Tıp Fakültesi (Türkçe), Temel Tıp Bilimleri Bölümü
Akademik Ünvanlar / Görevler
2018 - Devam Ediyor
2018 - Devam EdiyorAraştırma Görevlisi
Hacettepe Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Biyoistatistik A.B.D.
Makaleler
Tümü (47)
SCI-E, SSCI, AHCI (35)
SCI-E, SSCI, AHCI, ESCI (38)
ESCI (3)
Scopus (35)
TRDizin (10)
Diğer Yayınlar (3)
2025
20251. Is It Possible to Determine Plasma Cytomegalovirus DNA Cut-off and Develop a Scoring System to Predict Cytomegalovirus Gastrointestinal Disease ?
Karahan G., ÖZYAVUZ ALP Ş., KAŞIKCI ÇAVDAR M., ALP A., SÖKMENSÜER C., KAV T.
TURKISH JOURNAL OF GASTROENTEROLOGY
, cilt.36, sa.12, 2025 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)
2025
20252. The Comparison of Postoperative Quality of Life of Children and Adolescents who Underwent Minimally Invasive and Major Surgery for Vesicoureteral Reflux Disease: A Retrospective Cohort Study
Hazir B., Ayva M., KAŞIKCI ÇAVDAR M., Cak H. T., TEKGÜL S., DOĞAN H. S.
JOURNAL OF UROLOGICAL SURGERY
, cilt.12, sa.4, ss.219-225, 2025 (ESCI, TRDizin)
2025
20253. Clinical and Immunological Features of a Large DiGeorge Syndrome Cohort
Süleyman M., Cagdas D. N., Kiper P. Ö. Ş., Ütine G. E., Çavdar M., Tezcan F. İ.
JOURNAL OF CLINICAL IMMUNOLOGY
, sa.1, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2025
20254. Multimodal prediction of psychotic-like experiences using elastic net modeling: external validation in a clinical sample
Arslan S., KAŞIKCI ÇAVDAR M., DAĞ O., Sahin-Cevik D., Cakmak I. B., Vassos E., et al.
PSYCHOLOGICAL MEDICINE
, cilt.55, 2025 (SCI-Expanded, SSCI, Scopus)
2025
20255. Metabolic Profile of Male Cannabis Users and Estimation of Candidate Biomarkers
Oz E., Kasikci M., Celik İ., Gurler M.
CHEMICAL RESEARCH IN TOXICOLOGY
, cilt.38, sa.10, ss.1762-1770, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2025
20256. Incidence of Unexpected Lymph Node Positivity and Its Prognostic Impact in Patients Undergoing Pulmonary Metastasectomy
Kumbasar U., DİZDAR Ö., Uysal S., Yilmaz Y., Aydar I., KAŞIKCI ÇAVDAR M., et al.
INDIAN JOURNAL OF SURGERY
, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2025
20257. Leveraging Deep Learning to Enhance Malnutrition Detection via Nutrition Risk Screening 2002: Insights from a National Cohort
YALÇIN N., KAŞIKCI ÇAVDAR M., Kelleci-Cakir B., Demirkan K., Allegaert K., Halil M., et al.
NUTRIENTS
, cilt.17, sa.16, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2025
20258. INVESTIGATION OF FACTORS AFFECTING HOME EXERCISE ADHERENCE AFTER TOTAL KNEE ARTHROPLASTY
Basyigit A., Kocaman A. A., KAŞIKCI ÇAVDAR M., Calbiyik M.
ANNALS OF THE RHEUMATIC DISEASES
, cilt.84, ss.1758-1759, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2025
20259. Quantitative Immunoglobulin G and Interferon-Gamma Responses After Different Booster Strategies of CoronaVac and BNT162b2 Vaccines in Turkiye
Ocakli A. I., Ozyar-Kurtcu S. A., Uzun M., KAŞIKCI ÇAVDAR M., Telli-Dizman G., METAN G., et al.
INFECTIOUS DISEASES AND CLINICAL MICROBIOLOGY
, cilt.7, sa.2, ss.156-165, 2025 (ESCI, TRDizin)
2025
202510. Development, Reliability, and Validity of the Telerehabilitation Usability Questionnaire in Neurological Diseases
Eldemir K., Eldemir S., Saygılı F., Özkul Ç., Kaşıkcı Çavdar M., Güçlü Gündüz A.
Gümüşhane Üniversitesi Sağlık Bilimleri Dergisi
, cilt.14, sa.1, ss.124-132, 2025 (TRDizin)
2024
202411. Pharmacist-Implemented Self-Management Module in Multiple Sclerosis Patients: A Randomized Controlled Trial
Goncuoglu C., Ozen P. A., KAŞIKCI ÇAVDAR M., Tuncer A., Ekincioglu A. B.
CANADIAN JOURNAL OF NEUROLOGICAL SCIENCES
, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
202412. Comparison of the Disease Course of COVID-19 and Seasonal Coronavirus Infections in Children.
Aykac K., Demir M., Kasikci M., Cengiz A. B., Ozsurekci Y.
The Pediatric infectious disease journal
, cilt.43, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
202413. Comparison of autologous venous grafts and three types of extracellular matrix grafts in Peyronie’s disease surgery
SOYDAŞ T., ÜNAL S., UZUNDAL H., KAŞIKCI M., KUTLUHAN M. A., OKULU E., et al.
Turkish Journal of Medical Sciences
, cilt.54, sa.5, ss.893-899, 2024 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)
2024
202414. twowaytests: An R package for two-way tests in independent groups designs
DAĞ O., KAŞIKCI ÇAVDAR M., Yilmaz M. A., Weerahandi S., Ananda M. M. A.
SOFTWAREX
, cilt.27, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
202415. Has the Coronavirus Disease 2019 Pandemic Played a Role in the Early Detection of Pulmonary Embolism in Children?
Eryilmaz Polat S., Akyan Soydaş Ş. S., Ocak E., Gençoğlu M. Y., Uytun S., Özkan Tabakci S., et al.
Journal of pediatric hematology/oncology
, cilt.46, sa.6, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
202416. A Novel Machine-Learning Algorithm to Predict the Early Termination of Nutrition Support Team Follow-Up in Hospitalized Adults: A Retrospective Cohort Study.
Yalçın N., Kaşıkcı M., Kelleci-Çakır B., Allegaert K., Güner-Oytun M., Ceylan S., et al.
Nutrients
, cilt.16, sa.15, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
202417. Development, reliability, and validity of the telerehabilitation satisfaction questionnaire in neurological diseases.
Eldemir S., Eldemir K., Saygili F., Ozkul C., Kasikci M., Yilmaz R., et al.
International journal of medical informatics
, cilt.191, ss.105578, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
202418. Risk assessments of drug-related problems for cardiac surgery patients.
Kelleci Çakır B., Kaşıkcı M., Aydın A., Yılmaz M., Bayraktar-Ekincioglu A.
The American journal of managed care
, cilt.30, sa.5, 2024 (SCI-Expanded, SSCI, Scopus)
2024
202419. Galectin-3 levels in children with cystic fibrosis
Ademhan Tural D., EMİRALİOĞLU ORDUKAYA N., AKIN Ş., Alboga D., Ozsezen B., Nayir Buyuksahin H., et al.
European Journal of Pediatrics
, cilt.183, sa.5, ss.2333-2342, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
202420. Acute Effect of Kinesiology Taping on Muscle Activation, Functionality and Proprioception in Patients With Knee Osteoarthritis: A Randomized Controlled Trial
Ataş A., Abit Kocaman A., Karaca Ş. B., KAŞIKCI ÇAVDAR M.
Perceptual and Motor Skills
, cilt.131, sa.2, ss.446-468, 2024 (SSCI, Scopus)
2024
202421. Relationship between the Common Variants of the ADAM19, FAM13A, and IREB2 Genes and COPD Susceptibility and Severity
Senel M. Y., Kabacam S., KAŞIKCI ÇAVDAR M., Onder B. Ş., ŞİMŞEK KİPER P. Ö., ÜTİNE G. E., et al.
INDIAN JOURNAL OF RESPIRATORY CARE
, cilt.13, sa.2, ss.83-90, 2024 (ESCI)
2024
202422. The airway microbiota in siblings with primary ciliary dyskinesia: Related factors and correlation with clinical characteristics.
Ademhan Tural D., Kasikci M., Eryilmaz Polat S., Ozsezen B., Hizal M., Sunman B., et al.
Pediatric pulmonology
, cilt.59, sa.3, ss.695-706, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
202423. A Methodological Research on Radiogenomics: Combining Radiomics and Genomics for Classification
Kaşıkcı M., Coşgun E., Karabulut E.
Türkiye Klinikleri Biyoistatistik Dergisi
, cilt.16, sa.1, ss.16-37, 2024 (TRDizin)
2024
202424. Validity and reliability of the MetabQoL 1.0 and assessment of neuropsychiatric burden in organic acidemias: Reflections from Turkey
Ersak A. Ş., Çak H. T., YILDIZ Y., Çavdar M., Tunç S., ÖZER N., et al.
Molecular Genetics and Metabolism
, cilt.141, sa.1, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2023
202325. Development and validation of machine learning-based clinical decision support tool for identifying malnutrition in NICU patients
Yalçın N., Kaşıkcı M., Çelik H. T., Demirkan K., Yiğit Ş., Yurdakök M.
Scientific Reports
, cilt.13, sa.1, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2023
202326. Investigation of the instant effect of Kinesio Taping on the rectus femoris muscle on pain and functional disability in knee osteoarthritis patients
Abit Kocaman A., Ataş A., Karaca Ş. B., Kaşıkçı Çavdar M.
Journal of Orthopedics Research and Rehabilitation , cilt.1, sa.3, ss.58-62, 2023 (Hakemli Dergi)
2023
202327. Segmental hair metabolomics analysis in pregnant women with pregnancy complications
Najafova T., Dagdeviren G., Kasikci M., Sahin D., Yucel A., Ozyuncu O., et al.
Metabolomics : Official journal of the Metabolomic Society
, cilt.19, sa.5, ss.45, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2023
202328. Impact of clinical pharmacist-led intervention for drug-related problems in neonatal intensive care unit a randomized controlled trial
Yalçın N., Kaşıkcı M., Çelik H. T., Allegaert K., Demirkan K., Yiğit Ş.
Frontiers in Pharmacology
, cilt.14, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2023
202329. Development and validation of a machine learning-based detection system to improve precision screening for medication errors in the neonatal intensive care unit
Yalcin N., Kasikci M., Celik H. T., Allegaert K., Demirkan K., Yigit Ş., et al.
Frontiers in Pharmacology
, cilt.14, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2023
202330. ASSESSMENT OF VASCULARITY WITH DOPPLER ULTRASONOGRAPHY METHODS IN PATIENTS OF PUBERTY PRECOCIOUS WITH THELARCHE
Öztürk C., Güngör Ö., Buluş D., Kaşıkcı M., Uysal Ramadan S.
Kocatepe Tıp Dergisi
, cilt.24, sa.1, ss.83-88, 2023 (TRDizin)
2023
202331. GeneSelectML: a comprehensive way of gene selection for RNA-Seq data via machine learning algorithms.
Dag O., Kasikci M., Ilk O., Yesiltepe M.
Medical & biological engineering & computing
, cilt.61, sa.1, ss.229-241, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2023
202332. The Effect of Missing Data Mechanisms on Deep Learning in Binary Classification: A Simulation Study
ÖZTÜRK E., ZENGİN H. Y., KAŞIKCI ÇAVDAR M., COŞGUN E.
Türkiye Klinikleri Biyoistatistik Dergisi
, cilt.15, sa.1, ss.1-12, 2023 (TRDizin)
2023
202333. A new instrument to assess physical function in stroke patients: the Dubousset function test and its validity, reliability, responsiveness
Bozkurt Y. E., Abit Kocaman A., KAŞIKCI ÇAVDAR M., Keskin E. D.
Neurological Research
, cilt.45, sa.12, ss.1127-1135, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2022
202234. Evaluation of the Efficiency of Simulated Patient Application in Emergency Case Management In-Service Training of Prehospital Health Personnel
Sezgin A., Kınıklı G. İ., Kaşıkcı M.
Hastane Öncesi Dergisi
, cilt.7, sa.3, ss.317-330, 2022 (Hakemli Dergi)
2022
202235. An Artificial Intelligence Approach to Support Detection of Neonatal Adverse Drug Reactions Based on Severity and Probability Scores: A New Risk Score as Web-Tool
Yalçın N., Kaşıkcı M., Çelik H. T., Allegaert K., Demirkan K., Yiğit Ş., et al.
CHILDREN (BASEL)
, cilt.9, sa.12, ss.1-10, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)
2022
202236. Can expected pCO2 be calculated by pCO2=HCO3+15 formula in central venous blood gas samples?
Yuksel M. E., Izdes S., Aydar I., Kasikci M.
European review for medical and pharmacological sciences
, cilt.26, sa.19, ss.6985-6989, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)
2022
202237. Novel Method for Early Prediction of Clinically Significant Drug–Drug Interactions with a Machine Learning Algorithm Based on Risk Matrix Analysis in the NICU
Yalçın N., Kaşıkcı Çavdar M., Çelik H. T., Allegaert K., Demirkan K., Yiğit Ş., et al.
JOURNAL OF CLINICAL MEDICINE
, cilt.11, sa.16, ss.1-13, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)
2022
202238. 6-18 Yaş Arası Sendromik Olmayan Türk Çocuklarında Süpernumere Premolarların Prevalansı ve Özellikleri: Retrospektif Bir KIBT Çalışması
Ballıkaya E., Koç N., Kaşıkcı Çavdar M.
Selcuk Dental Journal
, cilt.9, sa.2, ss.471-478, 2022 (TRDizin)
2022
202239. A twenty years' results of the antimicrobial resistance profile and multidrug resistance trend of invasive Streptococcus pneumoniae isolates recovered from adult patients in Turkey: A literature review.
Hascelik G., Sancak B., Kasikci M.
Indian journal of medical microbiology
, cilt.40, sa.3, ss.342-346, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)
2022
202240. ULTRASOUND ELASTOGRAPHY FINDINGS IN SJÖGREN’S SYNDROME
Güngör Ö., Şahin K., Öztürk C., Uysal Ramadan S., Can S., Kaşıkcı Çavdar M.
Ankara Eğitim ve Araştırma Hastanesi Tıp Dergisi
, cilt.55, ss.23-27, 2022 (TRDizin)
2022
202241. The impact of the Adenotonsillectomy on cardiac functions and oxidative stress
Ozbilgic T., Suslu A. E., Aykan H. H., Pehlivanoglu B., Onal D., Kasikci M., et al.
International Journal of Pediatric Otorhinolaryngology
, cilt.154, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)
2021
202142. The Results of Trabeculectomy with Antimetabolites in Elderly Patients: A Retrospective Study
Dikmetaş Ö., Lotfisadigh S., Kaşıkcı M., Çankaya A. B., Kocabeyoğlu S.
Acta Medica (formerly Hacettepe Medical Journal) , cilt.52, sa.2, ss.162-166, 2021 (Hakemli Dergi)
2021
202143. Classification performance comparison of deep learning and classical data mining methods on RNA-Seq data set
Kasikci M., Cosgun E., KARABULUT E.
INTERNATIONAL JOURNAL OF DATA MINING AND BIOINFORMATICS
, cilt.26, sa.3-4, ss.188-201, 2021 (SCI-Expanded, Scopus)
2020
202044. Relationship between Abdominal Aortic Calcification, Abdominal Adiposity, and Liver Density
Ozturk C., Gungor O., Kaplanoglu V., KAŞIKCI M., Ramadan S. U.
JCPSP-JOURNAL OF THE COLLEGE OF PHYSICIANS AND SURGEONS PAKISTAN
, cilt.30, sa.12, ss.1245-1250, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)
2020
202045. Investigation of Cardiovascular System Findings and Affecting Factors Before and After Adenotonsillectomy Operation in Children with Obstructive Sleep Apnea Accompained by Adenotonsillar Hypertrophy
Ozbilgic T., SÜSLÜ A. E., AYKAN H. H., PEHLİVANOĞLU B., ÖNAL D., KAŞIKCI M., et al.
EUROPEAN RESPIRATORY JOURNAL
, cilt.56, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)
2020
202046. Lymphocyte Subgroups and KREC Numbers in Common Variable Immunodeficiency: A Single Center Study
Yaz I., Ozbek B., Ng Y. Y., Cetinkaya P. G., Halacli S., TAN Ç., et al.
JOURNAL OF CLINICAL IMMUNOLOGY
, cilt.40, sa.3, ss.494-502, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)
Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler
2025
20251. IN-SERVICE TRAINING OF PRE-HOSPITAL HEALTH PERSONNEL IN EMERGENCY CASE MANAGEMENT WITH SIMULATED PATIENT
SEZGİN A., KINIKLI G. İ., KAŞIKCI ÇAVDAR M.
SESAM2025, Valencia, İspanya, 25 - 27 Haziran 2025, (Özet Bildiri)
2023
20232. Comparison of Clinical Features of Aquaporin-4 Positive Neuromyelitis Optica Spectrum Disorder (NMOSD), Myelin Oligodendrocyte Glycoprotein (MOG) Associated Disorder, and Seronegative NMOSD - A Single Center Experience
Ozbek E. D., ÇAKAN ERCAN M., ACAR ÖZEN N. P., ÇOLPAK IŞIKAY A. İ., KAŞIKCI ÇAVDAR M., KARABUDAK R., et al.
9th Joint ECTRIMS-ACTRIMS meeting, Milan, İtalya, 11 - 13 Ekim 2023, ss.660-661, (Özet Bildiri)
2023
20233. PARAMETRIC BOOTSTRAP BASED SIMULATION ON IDENTIFICATION OF DIFFERENTIALLY EXPRESSED GENES: WHICH ONE OF BORUTA OR ELASTIC NET PERFORMS BETTER?
Kaşıkcı Çavdar M., Saman Ö., Dağ O.
12th International Conference of the International Biometric Society’s Eastern Mediterranean Region, İzmir, Türkiye, 8 - 11 Mayıs 2023, ss.56, (Özet Bildiri)
2022
20224. Türkiye’de CoronaVac ve BNT162b2 Aşılarının Farklı Uygulama Stratejileri Sonrası Kantitatif IgG ve T Hücre Interferon-gamma Yanıtlarının Değerlendirilmesi
Somun A. İ., Özyar Ş. A., Uzun M., Kaşıkcı Çavdar M., Telli Dizman G., Metan G., et al.
XL. Uluslararası Türk Mikrobiyoloji Kongresi, Antalya, Türkiye, 16 - 20 Kasım 2022, ss.383-384, (Özet Bildiri)
2022
20225. Effect of platelet-rich fibrin on colonic anastomosis
Mahmudzada K., GÜNER G., DİNÇSOY A. B., KAŞIKCI M., ERDEM A., EROL T.
31st Biennial Congress of ISUCRS (International Society of University Colon and Rectal Surgeons), İstanbul, Türkiye, 27 Ekim 2022, (Özet Bildiri)
2022
20226. The airway microbiota in siblings with primary ciliary dyskinesia: related factors and correlation with clinical characteristics
Ademhan Tural D., Kaşıkcı Çavdar M., Altay O., Eryilmaz Polat S., Ozsezen B., Hizal M., et al.
ERS International Congress 2022 abstracts, Barcelona, İspanya, 4 - 06 Eylül 2022, ss.3579, (Özet Bildiri)
2022
20227. A Comprehensive Real Data-Based Simulation Study on Gene Selection Performance of Machine Learning Algorithms
Kaşıkcı Çavdar M., Dağ O.
2022 International Biometric Conference, Riga, Letonya, 10 - 15 Temmuz 2022, (Yayınlanmadı)
2019
20198. Transkriptom Veri Seti Üzerinde Derin Öğrenme Yöntemi ile Klasik Veri Madenciliği Yöntemlerinin Sınıflama Performanslarının Karşılaştırılması
Kaşıkcı Çavdar M., Coşgun E., Karabulut E.
21. Ulusal ve 4. Uluslararası Biyoistatistik Kongresi, Antalya, Türkiye, 26 - 29 Ekim 2019, ss.32-33, (Özet Bildiri)
2019
20199. Comparison of classification performances on transcriptomics dataset
Kaşıkcı Çavdar M., Coşgun E., Karabulut E.
40th Annual Conference of the International Society for Clinical Biostatistics, Leuven, Belçika, 14 - 18 Temmuz 2019, ss.193-194, (Özet Bildiri)
Desteklenen Projeler
2020 - 2024
2020 - 2024Gen Seçimi için Makine Öğrenmesi Algoritmalarının Karşılaştırılması ve Yeni Bir Web Tabanlı Yazılım Geliştirilmesi: Alzheimer Hastalığı Üzerine Bir Uygulama
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
DAĞ O. (Yürütücü), KAŞIKCI M., İLK DAĞ Ö., YEŞİLTEPE M.
2022 - 2023
2022 - 2023TROMBOSİTTEN ZENGİN FİBRİNİN KOLON ANASTOMOZU ÜZERİNE ETKİSİ
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Doktora
EROL T. (Yürütücü), KAŞIKCI M., GÜNER G., DİNÇSOY A. B., ERDEM A., Mahmudzada K.