Molecular modelling studies of TRPV1 receptor antagonists

---

Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Hacettepe Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Kimya A.B.D., Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2010

Tezin Dili: İngilizce

Öğrenci: TUĞBA TAŞKIN

Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): FATMA SEVİN DÜZ

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

TRPV1 reseptörün çeşitli proteinlerle etkileştiği ve ağrı sinyallerini iyileştirici ve düzenleyici etkisi olan multiprotein kompleksin oluştuğu bilinmektedir. Bundan dolayı, moleküler mekanizma olarak ağrıyı anlamak için; biyolojik aktivitesi bilinen 6,6- ve 5,6- kaynaşık heterosiklik üre temelli bileşiklerin, QSAR (Nicel Yapı ve Aktivite ilişkileri) metoduyla yapı-aktivite ilişkileri belirlenmiştir. [Taskin T. and Sevin F., 2009]. Farmakofor Modelleme ile TRPV1 reseptörüyle uygun etkileşime girebilecek bileşik serileri (analog serileri) tasarlanmış ve bunların arasından da en iyi aktiviteye sahip bileşik veya bileşikler saptanmıştır.Son olarak ise, bulunan bileşiklerin doğruluğunu ve etkileşimlerini görsel olarak görmek ve kanıtlamak için, Moleküler Docking yöntemi uygulanarak, TRPV1 reseptörünün aktif bölgesiyle kenetlenebilecek en uygun örtüşen yapıyı ve en uygun konformasyonu Discovery Studio 2.0 (DS 2.0) programı kullanılarak hesaplanmıştır. Bu metodlar doğrultusunda, en iyi aktiviteye sahip bileşik veya bileşikler saptanarak olası antagonist yapıları (ilaçlar) önerilmiştir.Anahtar Kelimeler: TRPV1, QSAR, Farmakofor Modelleme, Moleküler Docking.