Mikroarray tabanlı yeniden dizileme sistemi ile Wilson hastalarında ATP7B geninde moleküler genetik analizler

---

Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Hacettepe Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji A.B.D., Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2010

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: AYHAN YILMAZ

Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): RIZA KÖKSAL ÖZGÜL

Özet:

Bu tez çalışmasında, mikroarray tabanlı DNA yeniden dizileme çipi ve direkt DNA dizi analizi yöntemi kullanılarak, bakır metabolizması bozukluğu sonucu oluşan Wilson hastalığı için mutasyon taraması yapıldı.Mikroarray tabanlı DNA yeniden dizileme çipi kullanılarak, Wilson hastalığından sorumlu ATP7B geninin yirmi bir ekzonu, ekzon-intron bağlantısı ve kodlanmayan (5' UTR ve 3' UTR ) gen bölgeleri nükleotit seviyesinde analiz edildi. Mikroarray yeniden dizileme yöntemi ile tespit edilen mutasyonlar, direkt DNA dizi analizi yöntemiyle doğrulandı. Çalışma sonucunda, ATP7B geninde toplam on üç farklı mutasyon ve dokuz farklı polimorfizm saptandı. ATP7B geninde tespit edilen mutasyon ve polimorfizmler, daha önce literatürde tanımlanan mutasyonlardır. En sık görülen p.R778G ve p.H1069Q mutasyonlarının allel sıklıkları sırasıyla %31,25 ve %20.8 olarak belirlendi. ATP7B geninde yaygın olarak bulunan bu iki mutasyon, Türk toplumunda Wilson hastalarının mutasyonlarının daha hızlı taranmasında kullanıldı.Mikroarray tabanlı yeniden dizileme yöntemi, Wilson hastalarında genetik analizler için başarılı bir şekilde kullanılabilir. Bu yöntem özellikle yüksek işlem hacimli çok sayıda örneğin birarada değerlendirilmesinin gerekli olduğu, hızlı ve yüksek veri analizi içeren deney sistemleri için tercih edilmelidir.