Viridans grubu streptokokların tanısında kullanılan yöntemlerin karşılaştırılması ve antibiyotik direncinin araştırılması
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Hacettepe Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Mikrobiyoloji A.B.D., Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2016
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: ÖZBEN ÖZDEN
Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): DENİZ GÜR
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Viridans grubu streptokoklar, koyun kanlı agarda alfa-hemolitik veya non-hemolitik koloniler oluşturan, gram-pozitif kok şeklinde mikroorganizmalardır. Oral kavitede, üst solunum yollarında, gastrointestinal sistemde, ürogenital bölgede ve deride normal flora olarak yer alırlar. Dental işlemlerden sonra bakteriyemi, endokardit, menenjit ve septisemi yapabilirler. Bakterilerin hızlı ve doğru olarak tanımlanmaları tedavi başarısı için gereklidir. Taksonomik sınıflandırmaları ve tür isimlerinin değişmesi nedeniyle tanıda zorluklar yaşanmaktadır. Günümüzde otomatize sistemler ve moleküler yöntemlerin kullanımı ile bu sorun aşılmaya çalışılmaktadır. Bakterilerin en az mutasyona uğrayan bölgesi olan 16S rRNA bölgesi, bakterilerin filogenetik ilişkisinin ve genetik şifresinin değişmeyen bir bölgesidir. Taksonomik amaç için kullanılan 16S rRNA dizi analizi en doğru sonuç veren moleküler yöntemdir. Viridans grubu streptokokların sebep olduğu endokardit ve bakteriyeminin tedavisinde penisilinin tercih edilen bir ilaç olmasına karşın, son yıllarda çeşitli antibiyotiklere karşı direnç ortaya çıkmaktadır. Viridans grubu streptokokların antibiyotik duyarlılıklarının bilinmesi, ampirik tedavinin belirlenmesinde önemlidir. Bu çalışmada Hacettepe Üniversitesi merkez laboratuvarında, 2005-2013 yılları arasında çeşitli klinik örneklerden izole edilen ve otomatize sistem (Phoenix (Becton Dickinson, New Jersey, ABD) ile tanımlanmış olan 122 viridans grup streptokok suşu MALDI-TOF MS (BioMerieux, Fransa) yöntemi ile yeniden tanımlanmış ve tanımlamalar 16S rRNA dizi analiziyle doğrulanmıştır. Bunun yanısıra, European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) standartları esas alınarak penisilin, klindamisin, sefazolin, sefotaksim ve vankomisin için direnç oranları mikrodilüsyon yöntemi ile araştırılmıştır. Sonuç olarak, antibiyotik direnç oranları sırası ile; penisilin, klindamisin, sefazolin, sefotaksim ve vankomisin için sırası ile %52, %22,9, %33, %18, %0 bulundu. Phoenix sisteminin doğru tanımlaması %56,5 iken, VITEK MS ile viridans streptokok izolatları %86 doğru tanımlanıldı. VITEK MS viridans streptokokların tanımlanması için hızlı, güvenilir ve kolay yöntem olarak önerilebilir.