Silika ve polimer bazlı mikrokürelerin dna izolasyon özelliklerinin belirlenmesi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Hacettepe Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyomühendislik A.B.D., Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2016
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: GÜLÇİN GÜNAL
Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): SÜLEYMAN ALİ TUNCEL
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Bu tez kapsamında polimer ve silika bazlı mikropartiküller sentezlenmiştir. Bu partiküllerin DNA izolasyon kapasiteleri araştırılarak, DNA izolasyonu yapılabilecek yeni bir mikroekstraksiyon sisteminin geliştirilmesi amaçlanmıştır. Çalışmanın ilk kısmında DNA izolasyon deneylerinde sorbent olarak kullanılmak üzere, monodispers-makrogözenekli poli(gliserol-1,3-digliserolat diakrilat-co-gliserol dimetakrilat), poli(GDGDA-co-GDMA) mikropartiküller; monodispers-makrogözenekli silika mikropartiküller ve polidispers-mezogözenekli silika mikropartiküller sentezlenmiştir. Polimer mikropartiküllerin sentezi için çok basamaklı mikrosüspansiyon polimerizasyonu; monodispers ve polidispers silika mikropartiküllerin sentezi için ise sırasıyla çok basamaklı hidroliz-kondenzasyon yöntemi ile Stöber yöntemi kullanılmıştır. Partiküllerin yüzey özellikleri ile boy dağılımları taramalı elekton mikroskobu (Scanning Electron Microscope, SEM) ile özgül yüzey alanı ölçümleri ise Yüzey Alanı ve Gözenek Boyutu Ölçüm Cihazı ile Brunauer-Emmett-Teller (BET) modeli kullanılarak belirlenmiştir. Çalışmanın diğer kısmında, kesikli sistemde sorbentlerin denge DNA adsorpsiyon kapasiteleri tayin edilmiştir. Ortam pH'ı, sorbent ve DNA derişimlerinin değiştirilmesiyle sorbentlerin DNA adsorpsiyon davranışı incelenmiştir. En uygun adsorpsiyon ortamının belirlenmesinin ardından, farklı desorpsiyon tamponlarında desorpsiyon ve izolasyon verimleri belirlenerek en uygun desorpsiyon tamponu seçilmiştir. Bu alt yapı, sürekli sistemde DNA izolasyonunun en yüksek verimde yapılabilmesi için hazırlanmıştır. Sentezlenen sorbentlerin kesikli sistem davranışlarının incelenmesinin ardından, mikropartiküller silika kapiler kolona (iç çap: 300 mm, uzunluk: 40 mm) dolgulanmış ve mikro-enjeksiyon pompası yardımıyla hareketli faz akışı sağlanarak mikroakış tabanlı yeni bir DNA izolasyon sistemi geliştirilmiştir. Mikroekstraksiyon sisteminde farklı akış hızları ve DNA besleme derişimleri ile, DNA desorpsiyon ve izolasyon verimleri belirlenmiş ve izole edilen DNA'nın polimeraz zincir reaksiyon sistemi (Polymerase Chain Reaction System, PCR) ile karakterizasyonu yapılmıştır. Sonuçlar, DNA izolasyonu için mikroakış tabanlı yeni ekstraksiyon sisteminin geliştirildiğini; ve yeni üretilen monodispers silika mikropartiküllerin, yüksek verimle DNA izolasyonu yapabilecek, yeni bir DNA izolasyon sorbenti olarak kullanılabileceğini göstermiştir.