Kumarin-hidrazon temelli bir schıff bazı ile pepsin/hsa arasındaki bağlanma özelliklerinin spektroskopik ve moleküler kenetlenme metotları ile incelenmesi

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Hacettepe Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Kimya A.B.D., Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2020

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: ESRA ÖZGENÇ

Danışman: Elmas Gökoğlu

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Tez çalışması kapsamında kumarin-hidrazon temelli yeni bir schiff bazı sentezlenmiş (HZC) ve yapısı spektroskopik yöntemlerler karakterize edilmiştir. HZC ile protein (pepsin ve HSA) etkileşimleri spektroskopik (absorpsiyon, floresans) ve moleküler kenetlenme yöntemleri ile incelenmiştir. HZC-pepsin etkileşimleri pH 2.0 ve HZC-HSA etkileşimleri pH 7.4 tampon ortamlarında, farklı sıcaklıklarda çalışılmıştır. Florimetrik deneylerden elde edilen floresans sönüm sabitleri (Ksv), bağlanma sabitleri (K), bağlanma kısım sayıları (n) verilerinin işaret ettiği statik sönüm mekanizmasına göre HZC ve proteinler arasında kompleks yapı oluştuğu sonucuna varılmıştır. Ayrıca hesaplanan termodinamik parametrelere (G, H, S) göre bağlanma türleri açıklanmıştır. Negatif H ve pozitif S parametreleri, HZC'nin her iki proteinle bağlanmasında, hidrofobik kuvvetlerin yanında elektrostatik etkileşimlerin de rolü olduğu sonucunu göstermiştir. HZC'nin tezde önerilen florimetrik yöntemde, pepsin/HSA içeren deneysel ortamlardan nicel tayini için gözlenebilme sınırı (LOD) ve tayin sınırı (LOQ) değerleri hesaplanmıştır. Buna göre HZC için, LOD değeri pepsin ortamında 3.52x10-6 M ve HSA ortamında 3.81x10-7 M; LOQ değeri ise pepsin ortamında 1.17x10-5 M ve HSA ortamında 1.27x10-6 M olarak bulunmuştur. Förster teorisine göre, FRET yöntemi kullanılarak donör-akseptör molekülleri arasındaki uzaklık (r), HZC-pepsin için 3.67 nm ve HZC-HSA için 2.19 nm olarak hesaplanmıştır. Bu sonuçlar, türev-protein molekül çiftleri arasında ışımasız enerji aktarımının etkin olduğunu göstermiştir. Elde edilen deneysel veriler, moleküler kenetlenme sonuçları ile desteklenmiştir ve doğrulanmıştır. Gerek spektral ve gerekse hesaplamalı sonuçlar, HZC türevinin diğer benzer schiff bazı bileşikleri için iyi bir model olabileceğini ve ilaç tasarımı için de önemli moleküler türler olarak sınıflandırılabileceğini göstermektedir.