Yüzeyde güçlendirilmiş Raman spektroskopisi tekniği kullanılarak hedef DNA dizi tayini
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Hacettepe Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Gıda Mühendisliği A.B.D., Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2013
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: MEHMET ŞÖFÖROĞLU
Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): İSMAİL HAKKI BOYACI
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Bu çalışma kapsamında yüzeyde güçlendirilmiş Raman spektroskopisi (YGRS) tekniği kullanılarak hassas deoksiribonükleik asit (DNA) biyosensörü geliştirilmesi üzerine çalışılmıştır. Bu amaçla farklı özelliklere sahip iki manyetik partikül (Altın kaplı manyetik küre ve silika kaplı 3-aminopropiltrietoksisilan (APTS) modifiyeli manyetik nanopartikül) kullanılmıştır. Bunların yanında, YGRS etiketi olan 5,5-dithiobis (2-Nitrobenzoik asit) (DTNB) ile kaplanarak YGRS aktif hal getirilen ve bu sayede hedef dizilim varlığının saptanmasına olanak sağlayan altın nanoçubuklar kullanılmıştır. Çalışmada ilk adım olarak kullanılacak tüm partiküllerin yüzey modifikasyonlarını en düzgün şekilde yapabilmek ve ardından kurgulanan sistemden en iyi şekilde yararlanabilmek adına deney basamaklarındaki parametrelerin optimizasyonu yapılmıştır. Ardından genetik modifiye organizmaların (GMO) hızlı, seçici ve hassas bir şekilde analiz edilebilmesi amacıyla `sandviç analizi' olarak bilinen sistem uygulanmıştır. Bu sisteme göre hedef dizilime spesifik problarla modifiye edilmiş manyetik partikül, hedef dizilimin ortamdan seçici olarak ayrımına olanak sağlarken; DTNB ile kaplanmış altın nanoçubuklar ise DTNB molekülüne ait olan simetrik NO2 gerilmesine ait bant üzerinden gidilerek hedef dizilimin tayinine olanak sağlamaktadır. GMO analizine yönelik geliştirilen sisteme ait oluşturulan kalibrasyon eğrisinde 50-1000 nM aralığında çalışılmış ve elde edilen bant şiddetleri arasındaki R2 değeri 0,955 olarak bulunmuştur.