İdrar Örneklerin in Bakteri Varlığı Açısından Maldi-Tof Yöntemi ile Direk Tanımlanması ve Bakteri Tespiti Durumunda Direk İdrar Örneğinden Otomatize Antibiyotik Duyarlılık Sistemi ile Antibiyotik Duyarlılık Çalışılması


Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Hacettepe Üniversitesi, Tıp Fakültesi (Türkçe), Temel Tıp Bilimleri Bölümü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2016

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: MERAL AKARCA

Danışman: Ahmet Pınar

Özet:

Toplum ve hastane kaynaklı idrar yolu enfeksiyonları (İYE), oldukça sık görülen ve antibiyotik

tedavisi gerektiren hastalıklardır. Bu enfeksiyonlarda idrar kültürünün sonuçlanması ve

antibiyotik duyarlılık testinin de ek süre gerektirmesinden dolayı klinisyenler tarafından

genellikle ampirik antibiyotik tedavisi başlanmaktadır. Ampirik antibiyotik tedavisi toplum ya

da hastane kaynaklı İYE’de antibiyotik direncinin artmasına ve kimi zaman kullanılan

antibiyotiğin enfeksiyon ajanı olan bakteriye etkili olmaması nedeni ile tedavi başarısızlığına

ve yinelenen farklı antibiyotik kullanımına neden olmaktadır. İdrar yolu enfeksiyonlarında sık

olarak karşılaştığımız mikroorganizmaların hızlı şekilde tespit edilip, bu mikroorganizmaların

antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi, özellikle poliklinik koşullarında tedavi yönetimi,

komplikasyonların önlenmesi ve maliyet açısından yararlı sonuçlar verecektir.

Bu çalışmada, idrar kültürü amacıyla Hacettepe Üniversitesi Hastaneleri Merkez

Laboratuvarı’na gelen idrar örnekleri rutin uygulanan kültür işlemlerinden sonra agar plaklara

ekilmeden direkt VITEK MS (BioMérieux, Fransa) cihazına yüklenmiştir. Bakteri saptanması

durumunda, VITEK 2 (BioMérieux, Fransa) cihazı ile yine direkt idrar örneğinden

antibiyogram yapılmıştır. Böylelikle 48 saatlik bekleme süresine gerek kalmaksızın aynı gün

içerisinde etken mikroorganizma sonucunu ve 24 saat içerisinde antibiyotik duyarlılık

sonucunu verebilen bir prosedür geliştirmek amaçlanmıştır.

Çalışma kapsamında 3550 idrar kültürü örneğinden lökosit sayısı ve Gram boyama sonucuna

göre 446’sına MALDI-TOF MS yöntemi ile direkt tanımlama yapılırken, bunlar içerisinden 215

örneğe otomatize antibiyotik duyarlılık sistemi (VITEK 2) ile direkt antibiyotik duyarlılık

uygulanmıştır.

İYE ile başvuran hastalara çoğunlukla ≥105cfu/ml etken mikroorganizma üremesi olan kültür

sonucuna göre tedavi verildiği göz önünde bulundurulduğunda; İYE tanısında idrar

örneklerine direkt MALDI-TOF MS ile tanımlama ve beraberinde direkt VITEK 2 ile antibiyotik

duyarlılık uygulaması ile büyük oranda etken olan idrar yolu patojenlerinin tanımlanabileceği

ve antibiyotik duyarlılık sonuçlarının da en fazla 24 saat içerisinde alınabileceği tespit edilerek

bu kombine yöntemin maliyet etkin ve hasta açısından daha doğru tedavilerin daha kısa

sürede yapılmasına olanak veren alternatif bir yöntem olabileceği ortaya konmuştur.