TGFBI geninde Genom Düzenleme Tekniği ile Oluşturulan Varyasyonların Zebra Balığı Korneasındaki Fenotipik Etkilerinin İncelenmesi


Yaylacıoğlu Tuncay F., Talim B., Dinçer P. R.

14. Ulusal Tıbbi Genetik Kongresi, Ankara, Türkiye, 20 - 22 Kasım 2020, ss.57-58

  • Yayın Türü: Bildiri / Özet Bildiri
  • Basıldığı Şehir: Ankara
  • Basıldığı Ülke: Türkiye
  • Sayfa Sayıları: ss.57-58
  • Hacettepe Üniversitesi Adresli: Evet

Özet

Amaç: Zebra balığında tek kopya olan tgfbi geninde CRISPR/Cas9 teknolojisi kullanılarak 124. arjinin rezidüsünde varyasyon

oluşturulması ve varyasyon sonucunda zebra balığı korneasında meydana gelecek patolojik değişimlerin erişkin zebra balığında

incelenerek insan kornea distrofilerine yönelik in vitro model oluşturulması amaçlanmıştır.

Gereç-Yöntem: Tgfbi’de hedefteki arjinin rezidüsünü kodlayan bölgeye özgü CRISPR/Cas9 genom düzenleme araçları ve homoloji

bağımlı tamir mekanizması için hedefte yanlış anlamlı mutasyon taşıyan ssODN’ler tasarlanmıştır. Zebra balığı embriyolarına

yapılan enjeksiyonlar sonrası embriyolarda DNA’da kırık oluşumu T7 endonükleaz enzim 1 ile kesim analizi (T7EI) ve DNA

dizileme ile incelenmiştir. Hedefteki nükleotit değişikliği içinse restriksiyon enzimi ile kesim analizi (RFLP) kullanılmıştır. Hedefte

uygun değişikliğe sahip zebra balıklarından heterozigot F1 jenerasyonu elde edilmiş ve bu balıkların erişkin dönemde ötanazi

sonrası korneaları histopatolojik olarak değerlendirilmiştir.

Bulgular: Tgfbi’de hedef bölgedeki değişiklik homolog olmayan uç birleştirme tamir mekanizması ile oluşturulmuş olup hedef

arjinin amino asidini ortadan kaldıracak şekilde p. Ser115_Arg117delinsLeu varyasyonu elde edilmiştir. Varyasyonu heterozigot

olarak taşıyan 3 ve 12 aylık zebra balıklarının gözlerinde ışık mikroskobu ile yapılan histolojik incelemelerde hematoksilen eosin,

masson trikrom ve kongo kırmızısı ile boyamada birikim saptanmamıştır.

Sonuç: Tgfbi’de kornea distrofilerine neden olan 124. arjinin rezidüsünü zebra balığı genomunda ortadan kaldıran ilk çalışmadır.

Ancak erişkin zebra balıklarında insandakine benzer fenotipik bulgular ortaya çıkmamıştır.