Metrikler
Yayın
28
Açık Erişim
3
BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları
Eğitim Bilgileri
2012 - 2017
2012 - 2017Doktora
Hacettepe Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Kök Hücre Bilimleri, Türkiye
2008 - 2010
2008 - 2010Yüksek Lisans
Hacettepe Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Tıbbi Biyoloji , Türkiye
2003 - 2008
2003 - 2008Lisans
Hacettepe Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji, Türkiye
Yaptığı Tezler
2017
2017Doktora
İskelet Kası Dejenerasyonu Sürecinde Stromal Hücre Alt Gruplarının İncelenmesi
Hacettepe Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Kök Hücre Bilimleri
2010
2010Yüksek Lisans
KAS DOKUSU TAMİRİNDE ÇÖZÜNEBİLİR FAKTÖRLERİN GEN İFADESİNİN İNCELENMESİ
Hacettepe Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Tıbbi Biyoloji
Yabancı Diller
B2 Orta Üstü
B2 Orta Üstüİngilizce
Araştırma Alanları
Tıp
Tıbbi Biyoloji
Sağlık Bilimleri
Temel Tıp Bilimleri
Akademik Faaliyetlere Dayalı Araştırma Alanları
Avesis Araştırma Alanları
WoS Araştırma Alanları
Scopus Araştırma Alanları
Akademik Ünvanlar / Görevler
2018 - Devam Ediyor
2018 - Devam EdiyorÖğretim Görevlisi Dr.
Hacettepe Üniversitesi, Rektörlük-B, Rektörlük-M
Akademi Dışı Deneyim
2017 - 2019
2017 - 2019ARGE UZMAN
Teknoloji Geliştirme Bölgesi, THINKLAB Teknoloji, ARGE, ARGE UZMAN
2016 - 2018
2016 - 2018Şirket Müdürü
THINKLAB Teknolojik Hiz. Tic. Ltd.Şti, Şirket Müdürü
2014 - 2017
2014 - 2017ARGE UZMAN
Teknoloji Geliştirme Bölgesi, Hemosoft bilişim eğitim hizmetleri a.ş, ARGE, ARGE UZMAN
2014 - 2016
2014 - 2016ARGE PERSONELİ
HEMOSOFT Bilişim ve Eğitim Hiz. A..Ş., ARGE PERSONELİ
2011 - 2014
2011 - 2014ARGE UZMAN
Teknoloji Geliştirme Bölgesi, IDC SAVUNMA A.Ş, ARGE, ARGE UZMAN
2011 - 2014
2011 - 2014ARGE PERSONELİ
IDC SAVUNMA SANAYİİ TİC. A.Ş, ARGE PERSONELİ
Makaleler
Tümü (17)
SCI-E, SSCI, AHCI (15)
SCI-E, SSCI, AHCI, ESCI (16)
ESCI (1)
Scopus (16)
2025
20251. Evaluation of cartilage regeneration using a hybrid bilayer scaffold based on omentum: evidence of limited efficacy
Oral M., Dedeogullari E. S., Onen S., Ozdemir C., Muratoglu B., Caglar Z., et al.
JOURNAL OF ORTHOPAEDIC SURGERY AND RESEARCH
, cilt.20, sa.1, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2025
20252. Circadian rhythm and aryl hydrocarbon receptor crosstalk in bone marrow adipose tissue and implications in leukemia
Muratoglu B., ÖZDEMİR SAKA C., EYLEM C. C., REÇBER T., NEMUTLU E., YET İ., et al.
SCIENTIFIC REPORTS
, sa.1, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2025
20253. Detailed characterization of bone marrow adipose tissue mesenchymal stem cells in healthy donor, Fanconi anemia, and acute myeloid leukemia
Muratoglu B., ÖZDEMİR SAKA C., EYLEM C. C., REÇBER T., NEMUTLU E., ALPDÜNDAR BULUT E., et al.
BONE
, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2025
20254. Simple Isolation of Human Bone Marrow Adipose Tissue-Derived Mesenchymal Stem/Stromal Cells
Tonyali G., Kilic E., Muratoglu B., ALPDÜNDAR BULUT E., ÖZDEMİR SAKA C., Uckan-cetinkaya D.
CURRENT PROTOCOLS
, cilt.5, sa.1, 2025 (ESCI, Scopus)
2024
20245. Upstream Process Protocol for MSCs Isolated from Different Human-Based Tissue Origins.
Kılıç P., Özdemir C., Coşar B., Savran B. N., Sarıkaya A., Sargon B., et al.
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
, 2024 (Scopus)
2024
20246. Circadian-based metabolomics and lipidomics of bone marrow adipose tissue and implications in myeloid leukemia pathogenesis: the crucial role of cell synchronization
Muratoglu B., ÖZDEMİR SAKA C., Recber T., Eylem C. C., Nemutlu E., Uckan-Cetinkaya D.
FEBS OPEN BIO
, ss.259, 2024 (SCI-Expanded)
2023
20237. Multiparametric analysis of etoposide exposed mesenchymal stem cells and Fanconi anemia cells: implications in development of secondary myeloid malignancy
ÖZDEMİR SAKA C., Muratoğlu B., Özel B., ALPDÜNDAR BULUT E., Tonyalı G., ÜNAL S., et al.
Clinical and Experimental Medicine
, cilt.23, sa.8, ss.4511-4524, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2023
20238. Pro-fibrogenic and adipogenic aspects of chronic muscle degeneration are contributed by distinct stromal cell subpopulations
ÖZDEMİR SAKA C., Akçay D., Yöyen-Ermiş D., Taşkıran E. Z., Soylu-Kucharz R., ESENDAĞLI G., et al.
PloS one
, cilt.18, sa.7, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2022
20229. Identification of mesenchymal stem cell subpopulations from bone marrow adipose tissue of Fanconi anemia and acute myeloid leukemia patients
Ozdemir C., Muratoglu B., Tonyali G., Uckan-Cetinkaya D.
FEBS OPEN BIO
, cilt.12, ss.98, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)
2022
202210. Investigation of time-course and dose-dependent regulation of circadian clock genes with aryl hydrocarbon receptor-induced human bone marrow mesenchymal stem cells
Muratoglu B., Ozdemir C., Ozmen E. B., Uckan-Cetinkaya D.
FEBS OPEN BIO
, cilt.12, ss.298, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)
2022
202211. Alterations in Hematopoietic and Mesenchymal Stromal Cell Components of the Osteopetrotic Bone Marrow Niche
Zeytin I. C., Alkan B., ÖZDEMİR SAKA C., ÇETİNKAYA F. D., OKUR F. V.
STEM CELLS TRANSLATIONAL MEDICINE
, cilt.11, sa.3, ss.310-321, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)
2021
202112. The investigation of mechanisms of secondary leukemia through etoposide exposed mesenchymal stromal cells
Ozdemir C., Ozel B. N., Bulut E. A., Cetinkaya D. U.
FEBS OPEN BIO
, cilt.11, ss.424, 2021 (SCI-Expanded, Scopus)
2019
201913. Osteopetrotic induced pluripotent stem cells derived from patients with different disease-associated mutations by non-integrating reprogramming methods
OKUR F. V., Cevher I., ÖZDEMİR SAKA C., Kocaefe C., ÇETİNKAYA F. D.
STEM CELL RESEARCH & THERAPY
, cilt.10, 2019 (SCI-Expanded, Scopus)
2018
201814. The fibrogenic activation kinetics of stromal stem cells in three different skeletal muscle degeneration models
Ozdemir C., Akcay D., Ermis D. Y., ESENDAĞLI G., Kocaefe C.
FEBS OPEN BIO
, cilt.8, ss.93, 2018 (SCI-Expanded, Scopus)
2018
201815. GENERATION OF INDUCED PLURIPOTENT STEM CELLS FROM MESENCHYMAL STEM CELLS OF OSTEOPETROSIS PATIENTS BY TWO DIFFERENT INTEGRATION-FREE METHODS UNDER FEEDER-FREE CONDITIONS
Okur F. V., Cevher I., Kilic E., Ozdemir C., Kocaefe C., Cetinkaya D. U.
CYTOTHERAPY
, cilt.20, sa.5, 2018 (SCI-Expanded, Scopus)
2015
201516. AEBP1/ACLP is upregulated in differentiation, injury repair and fibrotic degeneration of skeletal muscle
Özdemir C., AKPULAT U., Akçay D., ONBAŞILAR İ., KOCAEFE Y. Ç.
JOURNAL OF MUSCLE RESEARCH AND CELL MOTILITY , cilt.36, sa.6, ss.549-550, 2015 (SCI-Expanded, Scopus)
2014
201417. Periostin is temporally expressed as an extracellular matrix component in skeletal muscle regeneration and differentiation
OZDEMIR C., Akpulat U., SHARAFI P., YILDIZ Y., ONBAŞILAR İ., Kocaefe C.
GENE
, cilt.553, sa.2, ss.130-139, 2014 (SCI-Expanded, Scopus)
Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler
2019
20191. Modeling Hematopoietic Niche in Osteopetrosis Using Patient-Derived Induced Pluripotent Stem Cells
cevher i., Alkan B., ÖZDEMİR SAKA C., ÇETİNKAYA F. D., OKUR F. V.
ESGCT, Barcelona, İspanya, 22 - 25 Ekim 2019, (Özet Bildiri)
2019
20192. Modeling haematopoietic niche in osteopetrosis using patient-derived induced pluripotent stem cells
Cevher I., Alkan B., Ozdemir C., Cetinkaya D. U., Okur F. V.
ESGCT 27th Annual Congress in collaboration with SETGyc Meeting, Barcelona, İspanya, 22 - 25 Ekim 2019, cilt.30, (Özet Bildiri)
2019
20193. Hematopoietic differentiation potential of induced pluripotent stem cells derived from osteopetrosis patients’xx peripheral blood mononuclear cells
Cevher I., Alkan B., Ozdemir C., CETINKAYA D., OKUR F. V.
ISSCR International Symposia, Amsterdam, Hollanda, 20 - 22 Şubat 2019, (Özet Bildiri)
2018
20184. Characterization of the Cellular Localization and Expression of AEBP1/ACLP Transcripts with an Unknown Function in Myoblasts
KILIÇ H. B., Akçay D., ÖZDEMİR SAKA C., KOCAEFE Y. Ç.
Molbiyokon’18, İzmir, Türkiye, 05 Eylül 2018, (Özet Bildiri)
2018
20185. Characterization of the Cellular Localization andExpression of AEBP1/ACLP Transcripts with anUnknown Function in Myoblasts
kılıç h. b., akçay d., sevim d., ÖZDEMİR SAKA C., KOCAEFE Y. Ç.
Molbiokon18 6th International Congress of theMolecular Biology Association of Turkey, 5 - 08 Eylül 2018, (Tam Metin Bildiri)
2018
20186. The Fibrogenic Activation Kinetics of Stromal Stem Cells in Three Different Skeletal Muscle Degeneration Models
ÖZDEMİR SAKA C., AKÇAY D., YÖYEN ERMİŞ D., ESENDAĞLI G., KOCAEFE Y. Ç.
43rd FEBS CONGRESS, 7 - 12 Temmuz 2018, (Tam Metin Bildiri)
2018
20187. Comparative Transcriptome Analysis of Distinct Stromal Cell Populations During Extracellular Matrix Remodeling in Skeletal Muscle
ÖZDEMİR SAKA C., AKÇAY D., YÖYEN ERMİŞ D., TAŞKIRAN Z. E., ESENDAĞLI G., KOCAEFE Y. Ç.
13th Meeting of the Mediterrranean Society of Myology, 27 - 29 Haziran 2018, cilt.37, ss.129-183, (Tam Metin Bildiri)
2018
20188. GENERATION OF INDUCED PLURIPOTENT STEM CELLS FROMMESENCHYMAL STEM CELLS OF OSTEOPETROSIS PATIENTSBY TWO DIFFERENT INTEGRATION-FREE METHODS UNDERFEEDER-FREE CONDITIONS
OKUR F. V., CEVHER İ., KILIÇ E., ÖZDEMİR SAKA C., KOCAEFE Y. Ç., ÇETİNKAYA F. D.
ISCT, 2 - 05 Mayıs 2018, (Tam Metin Bildiri)
2016
20169. Klf5 acts as a differentiation switch from proliferation to fusion in myoblasts
Akpulat U., YILDIZ Y., Ozdemir-Saka C., Akcay D., Kocaefe C.
41st FEBS Congress on Molecular and Systems Biology for a Better Life, Kusadasi, Türkiye, 3 - 08 Eylül 2016, cilt.283, ss.114, (Özet Bildiri)
2016
201610. AEBP1/ACLP is upregulated in differentiation, injury repair and fibrotic degeneration of skeletal muscle
Ozdemir C., Akpulat U., Onbasilar I., Kocaefe C.
41st FEBS Congress on Molecular and Systems Biology for a Better Life, Kusadasi, Türkiye, 3 - 08 Eylül 2016, cilt.283, ss.287, (Özet Bildiri)
Desteklenen Projeler
2024 - Devam Ediyor
2024 - Devam EdiyorAril Hidrokarbon Reseptör Yolak Aktivasyonunun Metabolom Değişimine Olan Etkisinin İncelenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans
YET İ. (Yürütücü), Duruoğlu S., NEMUTLU E., EYLEM C. C., ÖZDEMİR SAKA C., Muratoğlu B.
2024 - Devam Ediyor
2024 - Devam EdiyorOksidatif Stresin Amyotofofik Lateral Skleroz Uyarılmış Pluripotent Kök Hücrelerin Nöronal Yönde Farklılaşmaları Üzerindeki Etkisi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans
ÖZÇİMEN BATMAN B. (Yürütücü), ÇETİNKAYA F. D., Ocakcı Ö., OKUR F. V., SABUNCUOĞLU S., ÖZDEMİR SAKA C.
2023 - 2025
2023 - 2025Stres Uyaranlarının Nöronal Mikroçevre Elemanlarından Glial Hücreler Üzerine Etkilerinin İncelenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans
ÇETİNKAYA F. D. (Yürütücü), Coşkun N. A., ÖZDEMİR SAKA C., MURATOĞLU B.
2022 - 2025
2022 - 2025
Hemofagositik Bozuklukların Modellenmesine Yönelik Hücre Kalite/Arşiv Sistemi Oluşturulması ve Uyarılmış Pluripotent Kök Hücre Geliştirilmesinde Metabolik Düzenleme ile Süreç Optimizasyonu
TÜBİTAK - AB COST Projesi
(Proje Özeti)
ÇETİNKAYA F. D. (Yürütücü), ÖZDEMİR SAKA C., NEMUTLU E., ALPDÜNDAR BULUT E., OKUR F. V., AYTAÇ EYÜPOĞLU Ş. S., et al.
2022 - 2024
2022 - 2024Pediatrik Epilepside Erken Senesens Biyobelirteçlerinin Değerlendirilmesi Gelişimsel ve Bilişsel Fonksiyonlar Üzerine Etkilerinin Belirlenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
YALNIZOĞLU D. (Yürütücü), GÜNBEY C., ÖZDEMİR SAKA C., ÇETİNKAYA F. D., Muratoglu B.
2022 - 2024
2022 - 2024Kemik iliği yağ dokusunun eksojen uyaranlar varlığında değişen transkriptom ve metabolom dinamiğinin AML patogenezi yönünden araştırılması (220S759 numaralı TÜBİTAK projesi ek bütçe)
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ÖZDEMİR SAKA C. (Yürütücü)
2022 - 2023
2022 - 2023Akım sitometri ile kök hücre araştırmaları ve farklı kaynaklardan hücrelerin fonksiyonel analizleri
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Alt Yapı
OKUR F. V. (Yürütücü), ÇETİNKAYA F. D., ALPDÜNDAR BULUT E., ÖZDEMİR SAKA C.
2022 - 2023
2022 - 2023İnsan Somatik Hücrelerinin Uyarılmış Plüripotent Kök Hücreye Yeniden Programlanması Sürecinde Arilhidrokarbon Reseptörü Sinyalizasyonundaki Değişimlerin İncelenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans
ÇETİNKAYA F. D. (Yürütücü), ÖZÇİMEN B., ÖZDEMİR SAKA C., Sevindi S., Muratoğlu B.
2021 - 2023
2021 - 2023Multiomiks yaklaşımı ile kemik iliği yağ-spesifik Arilhidrokarbon reseptörünün AhR sirkadiyen saat regülasyonundaki rolünün incelenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Doktora
ÇETİNKAYA F. D. (Yürütücü), Muratoğlu B., ÖZDEMİR SAKA C.
2021 - 2023
2021 - 2023Kemik iliği yağ dokusunun eksojen uyaranlar varlığında değişen transkriptom ve metabolom dinamiğinin AML patogenezi yönünden araştırılması.
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
Özdemir Saka C. (Yürütücü)
2018 - 2021
2018 - 2021Mezenkimal dokularda TGFB1 ve IGF1 faktörlerinin bir epigenetik düzenleyici olarak Klf5 kontrolündeki rolünün araştırılması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Alt Yapı
KOCAEFE Y. Ç. (Yürütücü), ÖZDEMİR SAKA C., ŞİMŞEK R., BORA G., DÖKMECİ S.
2019 - 2020
2019 - 2020Topoizomeraz 2 inhibitörü Etoposidin Stromal Hücrelerin Dicer İfadesi Yönündeki Etkisinin Araştırılması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ÖZDEMİR SAKA C. (Yürütücü), ÇETİNKAYA F. D., ALPDÜNDAR BULUT E.
2015 - 2016
2015 - 2016İskelet Kası Dejenerasyonunda Rol Oynayan Stromal Hücre Populasyonunun Karakterizasyonu
TÜBİTAK Projesi , 1002 - Hızlı Destek Programı
KOCAEFE Y. Ç. (Yürütücü)