Desma ve DESMB knockout zebra balığı modellerinde desmin ifadesinin incelenmesi


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Hacettepe Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Tıbbi Biyoloji A.B.D., Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2017

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: CANSU KOYUNLAR

Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): PERVİN RUKİYE DİNÇER

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Kas dokusuna özgül temel ara filament proteini olan desmin, miyofibrillerin çekirdek, sarkolemma ve hücre içi organellerle bağlantılarını sağlayan geniş bir ağ yapısı oluşturarak, kas kasılması ve gevşemesi sırasında güç aktarımını kolaylaştırmaktadır. Desmin geni (DES) ile ilişkili hastalıkların altında yatan patofizyolojinin anlaşılması için kullanılan hayvan modellerinde, ortolog genlerin ifade olduğu dokuların analiz edilmesi gerekmektedir. Kas hastalıklarını modellemede birçok avantajı bulunan zebra balığında, DES ortoloğu iki homolog gen (desma ve desmb) bulunmaktadır. Grubumuz tarafından, yabanıl tip AB zebra balıklarında in sitü hibridizasyon deneyleri ile gerçekleştirilen ön çalışmalarda, desma ve desmb transkriptlerinin döllenmeden sonra 70. saate kadar benzer iskelet kası yerleşimi gösterdiği; ancak 70. saatten sonra, desma ağırlıklı olarak iskelet kasında ifade olurken, desmb'nin çoğunlukla düz kasta ifade edildiği gözlenmiştir. Tez çalışmasında, desma ve desmb'nin mRNA ve protein ifadelerinin, yabanıl tip AB, desma KO (-/-) ve desmb KO (-/-) zebra balıklarında karşılaştırılarak araştırılması amaçlanmıştır. Kantitatif gerçek zamanlı PZR çalışmasında, yabanıl tip AB balıklara göre, desma KO (-/-) balıklarda desma mRNA ifadesinin %99 ve desmb KO (-/-) balıklarda desmb mRNA ifadesinin %98 oranında göreceli olarak azaldığı bulunmuştur. Gerçekleştirilen tüm örnek in sitü hibridizasyon ve tüm örnek immünfloresan boyama çalışmalarında, desmb KO (-/-) zebra balıklarında desma'nın, iskelet kası ve kalp kasının yanında, bağırsakta da ifade olduğu saptanmıştır. Ancak, desma KO (-/-) balıklarda, desmb'nin 70. saatten itibaren çoğunlukla düz kasta ifade olduğu ve desma yokluğunda iskelet kasında ifade olmadığı gözlenmiştir.